Vedecká rada fakulty je zložená z významných odborníkov v oblasti filozofie, teológie a sociálnej práce, pôsobiacich na fakulte a na iných inštitúciách alebo vedeckých pracoviskách.
Prerokúva dôležité otázky rozvoja fakulty v oblasti vzdelávania a vedy, hodnotí vedecký výskum a prerokúva žiadosti o habilitácie a inaugurácie.
Predseda
Dr. h. c. prof. doc. JUDr. Marek Šmid, PhD.
Interní členovia
doc. Jozef Tiňo, PhD.
prof. PhDr. Mária Šmidová, PhD.
doc. Jozef Žuffa, PhD.
prof. ThLic. Miloš Lichner, D.Th.
prof. ThDr. Ladislav Csontos, PhD.
doc. ThLic. Krzysztof Trebski, PhD.
doc. Mgr. Lukáš Jeník, PhD.
doc. PaedDr. ThDr. Šimon Marinčák, PhD.,
prof. PhDr. Miroslav Karaba, PhD.
Externí členovia
prof. Ing. Peter Dubovský, Th.D.
prof. ICODr. Cyril Vasiľ
prof. Róbert Lapko, Th.D., PhD.
doc. Dr. Michal Altrichter Th.D.
prof. PhDr. Michal Valčo, PhD.
Fakultné zastúpenie v univerzitnej vedeckej rade
prof. ThDr. RNDr. Ladislav Csontos SJ, PhD.
prof. ThLic. Miloš Lichner SJ, D.Th.
Dr. h. c. prof. doc. Marek Šmid, PhD.
doc. Jozef Tiňo, PhD.
doc. Dr. Michal Altrichter Th.D.